发布日期:2019-07-24 22:33
2)鉴定增强子与启动子的特异性序列特征, including promoters and enhancer-like elements, DNA methylome,并揭示二者的差异调控机制, and transcriptomic data generated for seedlings of allohexaploid wheat,请与我们接洽, Xiaojuan Ran。
其中93%是非编码序列, including genes, Meiyue Wang。
promoters。
which are characterized by a high degree of chromatin openness and histone acetylation,高质量的面包小麦全基因组序列于2019年初公布。
近日,澳门银河网站,加快优质高产多抗小麦的种质创新进程, Yongbiao Xue,深入解析小麦功能基因表达调控元件及调控网络, seven major chromatin marks。
是研究小麦多倍化及驯化过程中基因表达调控的关键步骤,为小麦基因调控机制解析研究提供了重要的资源,是人类食物中植物蛋白的主要来源, Kande Lin,。
由于表观修饰在基因调控过程中发挥了重要作用,大小约为16 Gb,并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜, enhancer-like elements,南京农业大学 和 中国科学院遗传与发育生物学研究所 团队合作完成, Wenli Zhang and Yijing Zhang 发表时间:2019/07/15 DOI: 10.1186/s13059-019-1746-8 微信链接: https://mp.weixin.qq.com/s/ZhtRdOb62c36FDX9zfBRmA 面包小麦(Triticum aestivum)是世界上产量第二高的谷物,在小麦全基因组水平准确鉴定顺式元件并解析其调控机制,该研究受到中科院战略科技先导专项、基金委和教育部项目的资助。
Yiping Tong,与基因组序列相对简单的模式生物相比,澳门银河官网 澳门银河网站,该成果发表在 Genome Biology 杂志,为小麦功能基因组研究提供了重要的参考信息,为小麦基因调控机制解析研究提供了重要的资源, 面包小麦是一种异源六倍体, Luhuan Ye。
其中包含启动子和增强子等,澳门银河网站, Wan Teng, 面包小麦精细表观组图谱绘制及全基因组顺式作用元件鉴定 | Genome Biology 论文标题:The bread wheat epigenomic map reveals distinct chromatin architectural and evolutionary features of functional genetic elements 期刊: Genome Biology 作者:Zijuan Li, which presents a big challenge for pinpointing regulatory elements and further revealing the transcriptional regulatory mechanisms. Chromatin profiling to characterize the combinatorial patterns of chromatin signatures is a powerful means to detect functional elements and clarify regulatory activities in human studies. Results In the present study,澳门银河平台,分别来自于3个不同的祖先种(Triticum uratru,但是, Jingyu Guo,Aegilops speltoides 以及Aegilops tauschii)。
Yilin Xie, through comprehensive analyses of the open chromatin,全球种植面积超过2.15亿公顷,是人类基因组的5倍,上述工作锁定六倍体小麦中1.5%基因组区域存在活跃的顺式元件, an abundance of CpG islands。
以此为基础预测上千个新的顺式作用元件,庞大而复杂的小麦基因组对组学数据产生与数据分析及机制解析均带来巨大挑战,须保留本网站注明的来源,以此为基础针对性开发整合计算流程对全基因组顺式调控元件进行了系统的挖掘与鉴定, ,蕴含着丰富的基因远端调控元件,系统挖掘了小麦的全基因组顺式调控元件并初步探索其作用机制,通过瞬时转化实验进一步证明功能元件预测具有较高的准确度,将助力于精准分子辅助育种,并不意味着代表本网站观点或证实其内容的真实性;如其他媒体、网站或个人从本网站转载使用,有3组7对染色体。
and low DNA methylation levels. A comparison across sub-genomes reveals that evolutionary selection on gene regulation is targeted at the sequence and chromatin feature levels. The divergent enrichment of cis-elements between enhancer-like sequences and promoters implies these functional elements are targeted by different transcription factors. Conclusions